民办小学学费不同的原因主要可以归纳为以下几点：
资金来源不同
公办学校由国家行政部门设立并运营，其运营资金主要依赖于政府财政拨款。
民办学校则依靠自我筹集资金，其办学经费主要来源于企事业单位等社会力量。
规模和师资力量
公办学校的数量及办学规模均超越民办学校，并且教学设备更为齐全。
民办学校的师资队伍整体实力略逊一筹，同时教师流动率较高。
生源构成
公办学校通常接纳周边地区的学生，学生大多采取走读制（即通学）。
民办学校的学生则来自全国各地，家庭经济条件各异，这些学生通常在校内住宿，接受“全封闭式管理”。
学费标准
民办学校的学费通常较高，一般在一万以上，而公办学校的学费相对较低，大致在五千元左右。
性质定义
民办学校属于民间资本办学，某种程度上具有半公半私的特点，并且旨在盈利。
公办学校则是由国家出资兴办的国立教育机构，其办学宗旨并不以盈利为目的。
其他因素
私立学校没有政府资金支持，需要收取较高的学费来维持校园日常管理的开销和教师薪酬的支付。
私立学校自负盈亏，学费较高是为了保证教学水平。
私立学校通常设施较先进，因为需要吸引优秀教师，而公立学校的设施由上级主管部门统一审批，相对较为简单。
综上所述，民办小学学费不同主要是由于其资金来源、规模和师资力量、生源构成、学费标准、性质定义以及其他因素如设施投入和教师薪酬等因素综合决定的。