方圆小学存在的缺点包括：
高昂的学费：
学费在20000元左右，对于普通家庭来说是一笔不小的开支。
体罚问题：
有家长反映，班主任刘妍老师存在收红包和体罚学生的情况，包括罚站、罚下蹲、罚抄课文、打后脑勺等。此外，体罚在该校已经是常规项目，有资料显示2014年和2011年就有网友反映过此类问题。
教师流动性高：
由于种种原因，包括缺乏归属感，优秀老师不断流动，导致教职员工素质参差不齐。
住宿部问题：
住宿部的风气较差，住宿部的老师素质不高，存在骂人、不会讲道理和开导学生的情况，甚至有些贪心。
建议家长在选择学校时，可以综合考虑这些因素，以确保选择到最适合自己孩子的学校。