小学楼只有三层的原因主要涉及学生安全和便利性、建筑设计规范以及消防法规定。以下是详细解释：
学生安全和便利性
较高的楼层会增加学生上下楼的风险，也会增加疏散的困难。因此，为了保障学生的安全，小学教学楼的设计规范通常将最高层数限制在三层以内。
建筑设计规范
根据《中小学校建筑设计规范》，小学教学楼的楼层不应超过四层。此外，普通教室宜在四层以下，不宜超过四层。这些规定旨在确保学生的学习环境安全舒适。
消防法规定
根据我国消防法规定，教学楼只能控制在六层以内，幼儿园教学楼不能超过三层，中学不能超过四层，高中不能超过五层。每层楼还需要有安全独立的疏散楼梯，以确保学生的安全。由于小学生逃生能力较弱，较低的建筑层数在紧急情况下更有利于逃生。
综上所述，小学楼只有三层主要是为了保障学生的安全，遵守相关的建筑设计规范和消防法规定，同时考虑到学生的便利性和学校的实际需求。