湖南农业大学设有多个学院，以下是部分学院的列表：
1. 农业与生物技术学院
2. 资源与环境学院
3. 食品科学技术学院
4. 信息科学与工程学院
5. 经济管理学院
6. 人文学院
7. 法学院
8. 机电工程学院
9. 园艺学院
10. 生物科学技术学院
11. 植物保护学院
12. 动物科学技术学院
13. 动物医学院
14. 土木工程学院
15. 水利水电工程学院
16. 汽车服务工程学院
17. 车辆工程学院
18. 机械电子工程学院
19. 草业科学学院
20. 植物科学与技术学院
此外，湖南农业大学还设有创新创业学院、卓越工程师学院和交叉学科研究院等。
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