小院子的课程将“培养具有学院气质的人”作为学生的成长目标，聚焦四个发展子目标，分别为科技的理解与创新、自然的敬畏与探索、生活的热爱与向往、自我的悦纳与超越，一一对应小学院课程的四类课程，包括：
知新（科技）小学院
知新课程：包括创意编程社团、思维训练社团、自然拼读与英语绘本社团等。
知行（传美）小学院
知行课程：注重学生的实践能力和美感培养。
知雅（艺术）小学院
知雅课程：涵盖艺术相关的课程和活动，提升学生的艺术素养。
知恒（健体）小学院
知恒课程：强调身体健康和体育锻炼。
这些课程旨在全面发展学生的知识、技能、情感和价值观，帮助他们在科技、自然、生活和自我认知等方面取得均衡的发展。