通州区运河小学的学生可以通过以下几种方式上初中：
对口直升
通州区大稿新村小学和通州区潞河中学附属学校的学生可以直升通州区运河中学（南校区）。
公办寄宿
符合通州区入学资格的小学应届毕业生可以选择本区具有寄宿招生资格的学校，如理工附中通州校区、人大附中通州校区等。具体招生要求及录取原则以学校招生简章发布为准。
民办校
符合入学条件的小学应届毕业生可以在规定时间内到具有招生资格的民办学校申请入学，包括通州区民办校以及师达中学、北达资源中学、人分、人朝分等面向全市招生的民办校。
多校联合电脑派位
非本市户籍小学毕业生，在城区、永顺镇、梨园镇初中服务范围内的小学毕业的学生，按照“多校联合电脑派位”的方式进入通州区有空余学位的初中就读。在其他乡镇初中服务范围内的小学毕业的学生，到通州区初中联系就读。
建议家长和学生提前了解并确认各项入学政策和要求，以便选择最适合自己的升学途径。