超级计算机通常使用以下编程语言：
C/C++：
C/C++是一种广泛使用的编程语言，具有高效的性能和强大的硬件控制能力。它们可以直接操作计算机的底层硬件资源，适用于需要高度优化和控制的应用。C/C++在超级计算中尤其受到青睐，因为它们提供了对硬件的底层访问和控制，并具有高度的可移植性和效率。
Fortran：
Fortran是一种专门为科学计算和数值分析而设计的编程语言。它具有丰富的数学库和优化器，适用于编写高性能的数值计算程序。Fortran在超级计算领域具有悠久的历史，并且在科学计算中广泛应用。它支持大规模并行计算，在处理大规模数据集时具有出色的性能。
Python：
Python是一种简单易学的编程语言，也被广泛用于科学计算和数据分析。虽然Python的执行速度相对较慢，但它具有丰富的科学计算库（如NumPy、SciPy和Pandas），可以方便地进行数据处理和分析。Python在超级计算中的应用逐渐增长，通常用作“胶水语言”，将不同的软件组件和库连接在一起，从而加速开发过程。
Java：
Java是一种面向对象的编程语言，具有跨平台性和可扩展性。虽然Java的执行速度相对较慢，但它适用于开发大型复杂的超级计算应用程序。
MATLAB：
MATLAB是一种专门用于数值计算和数据可视化的高级编程语言。它在科学计算和工程计算中应用广泛，特别是在数值计算和算法开发方面。
此外，还有一些其他编程语言和库也常用于超级计算机的编程，例如MPI、CUDA、OpenMP、IB和OpenACC等，这些主要用于并行计算和优化。
建议
选择编程语言时，需要根据具体的应用需求、性能要求和开发环境来决定。对于需要极致性能的应用，C/C++和Fortran通常是首选。而对于需要快速开发和数据分析的应用，Python可能更为合适。Java和MATLAB则适用于需要跨平台性和高级算法开发的应用场景。