协议起诉程序一般包括以下几个步骤：
准备起诉状及相关证据材料
起诉状应包括原被告的基本信息、诉讼请求、事实和理由等。
证据材料应包括合同、协议、相关通信记录、交易凭证等，以证明原告的诉讼请求有充分的事实和法律依据。
确定管辖法院
根据《中华人民共和国民事诉讼法》，合同纠纷案件可以由被告住所地或合同履行地的人民法院管辖。
如果合同双方在合同签订时已经约定了管辖法院，则应优先遵循这一约定。
提交起诉材料并立案
将起诉状及相关证据材料提交至具有管辖权的人民法院。
法院在收到起诉材料后，会在七日内决定是否受理并立案。如果不予受理，会作出裁定书，当事人可以提起上诉。
庭前准备
一旦立案，法院会向被告送达起诉状副本，并通知其提出答辩状。
双方当事人应在法定期限内提交证据，法院会组织双方进行证据交换和质证。
开庭审理
法院会安排开庭时间，并通过传票通知双方当事人。
开庭审理包括法庭调查、质证、辩论和最后陈述等环节。
双方当事人可以在庭审中陈述自己的意见，提出证据和法律依据。
判决与上诉
法院在审理结束后，会根据庭审情况和证据作出判决。
当事人如果对一审判决结果有异议，可以在法定期限内向上一级人民法院提起上诉。
执行
如果判决生效后，被告未按时履行判决，原告可以申请法院强制执行。
建议在提起诉讼前，当事人应充分准备相关材料和证据，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议。