发那科数控系统删除机床程序的方法如下：
删除一个程序
选择编辑方式。
进入程序界面。
输入要删除的程序号，例如：O0001。
按DELETE（删除）键，即可删除指定的程序。
删除所有程序
选择编辑方式。
进入程序界面。
输入O-9999。
按DELETE（删除）键，所有程序将被删除。
删除指定范围内的程序
选择编辑方式。
进入程序界面。
以如下格式输入将要删除的程序号范围：OAAAA,OBBBB，其中AAAA代表将要删除程序的起始程序号，BBBB代表将要删除的程序的终了程序号。
按DELETE（删除）键，删除程序号OAAAA到OBBBB之间的程序。
在进行删除操作之前，请务必备份重要的程序和数据，以防意外丢失。同时，确保您有足够的权限进行此类操作，以免对系统造成不必要的损害。